事業再構築補助金の交付申請書類が差し戻しされたときの対処法とは?注意点や基本手順を解説!

COLUMN お役立ちコラム

2025.11.21

事業再構築補助金

事業再構築補助金の交付申請書類が差し戻しされたときの対処法とは?注意点や基本手順を解説!

事業再構築補助金では、何らかの不備が原因で差し戻しが発生するケースがあります。差し戻しを防止するために、事業再構築補助金の交付申請に必要な書類や注意点を事前に把握することが大切です。本記事では、事業再構築補助金の交付申請における注意点や、差し戻しされた場合の対処法を解説します。

事業再構築補助金は終了、新たに『新事業進出補助金』が開始!

事業再構築補助金は、2025年の3月の第13回公募をもって公募が終了しました。

その後継制度として、 2025年4月より「新事業進出補助金」 が新たにスタートしました。

新事業進出補助金とは

新事業進出補助金は、企業の成長促進・生産性向上・賃上げの実現を後押しするため、中小企業が新事業に挑戦し、新しい市場への進出するための支援制度です。

例えば、
・これまで扱っていなかった製品分野への進出
・新たな顧客層・業界への展開

などの取り組みに対し、設備投資や販路開拓の費用を補助します。

新事業進出補助金と事業再構築補助金の違い

新事業進出補助金は、事業再構築補助金の後継として始まった補助金ですが、両者には様々な違いがあります。

以下に、簡単に違いをまとめました。

  新事業進出補助金 事業再構築補助金・成長分野進出枠(通常類型)
補助対象者 企業の成長・拡大に向けた新規事業への挑戦を行う中小企業等 ポストコロナに対応した、成長分野への大胆な事業再構築にこれから取り組んだり、国内市場縮小等の構造的な課題に直面している業種・業態の中小企業・中堅企業等
補助上限額 9,000万円 7,000万円
補助率 1/2 中小企業等:1/2(2/3)
中堅企業等:1/3(1/2)
基本要件 (1)新事業進出要件
(2)付加価値額要件
(3)賃上げ要件
(4)事業場内最賃水準要件
(5)ワークライフバランス要件
(6)金融機関要件
(1)事業再構築要件
(2)金融機関要件
(3)付加価値額要件
(4)給与総額増加要件かつ市場拡大要件または市場縮小要件
補助事業期間 交付決定日から14ヶ月以内 交付決定日から12 か月以内
補助対象経費 機械装置・システム構築費、建物費、運搬費、技術導入費、知的財産権等関連経費、外注費、専門家経費、クラウドサービス利用費、広告宣伝・販売促進費 建物費、機械装置・システム構築費(リース料を含む)、技術導入費、専門 家経費、運搬費、クラウドサービス利用費、外注費、知的財産権等関連経費、 広告宣伝・販売促進費、研修費、廃業費

事業再構築補助金の採択者は新事業進出補助金を申請できる?

新事業進出補助金では、次のいずれかに該当する事業者は補助対象外となります。

・申請締切日を起点として過去16か月以内に、事業再構築補助金の補助金交付候補者として採択された事業者(採択辞退者を除く)
・申請締切日時点で、事業再構築補助金の交付決定を受けて補助事業を実施中の事業者

ただし、上記に該当しない場合は、事業再構築補助金に採択された実績があっても、新事業進出補助金の要件を満たすことで申請が可能です。

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事業再構築補助金とは?

新規事業や事業転換を計画する中小企業を支援する制度

事業再構築補助金とは、ウィズコロナ・ポストコロナの時代の経済社会の変化に対応するために変革を行う中小企業の挑戦を支援する補助金です。

2023年から補助金額の上限が最大5億円に引き上げられるなど、補助額の規模が大きく、中小企業の事業者に非常におすすめの補助金となっています。

▼最新情報はこちら

 

採択前の流れ

事業再構築補助金を受け取るには、所定の手続きを進めて申請を行い、採択される必要があります。
以下では、事業再構築補助金における採択までの基本的な流れを紹介します。

公募期間中に申請

事業再構築補助金には公募期間があり、その期間内に電子申請で申し込む必要があります。

電子申請には「GビズIDプライムアカウント」が必要になるため、事前に作成をしておくと良いでしょう。申請が初めての場合には分からないことも多いと予想されるため、公募期間をチェックして余裕のあるタイミングでの申請がおすすめです。

審査を受けて採択発表を待つ

公募期間中に申し込みをすることで、事業再構築補助金の審査を受けられます。

審査による採択発表・通知までは、公募の締め切りから2〜3か月程度かかることが一般的です。
採択されることで、補助金を受け取るための申請が可能になります。

採択後の流れ

事業再構築補助金の採択後は、以下の流れで申請と給付が実施されます。

1. 採択通知を受け取る
2. 交付申請を実施する
3. 交付決定通知を受け取り、申請した補助事業を実施する
4. 事業の実績報告を実施する
5. 「額確定通知」を受け取る
6. 内容を確認し、精算払請求を提出する
7. 補助金の振込を受ける
8. 事業化状況報告を提出する

採択通知後は速やかに交付申請を実施する

事業再構築補助金は採択されてからも、交付申請を実施して「交付決定通知」を受け取る必要があります

交付申請が受理されないと、採択されても補助金を受給できないため注意しましょう。
事業再構築補助金の申請には、採択後の交付申請までを含めてスケジュールを組むのがポイントです。

交付申請に必要な書類

事業再構築補助金の交付申請時には、複数の書類の提出が必要です。
以下では、交付申請で必要な書類を解説します。

交付申請時に必要な書類の種類

事業再構築補助金の交付申請時には、以下の書類が求められます。

法人の場合 個人事業主の場合
・履歴事項全部証明書 ・直近の決算書 ・見積書、見積依頼書 ・直近2期分の確定申告書(第一表) ・青色申告書/白色申告書 ・見積書、見積依頼書

<法人の場合>

履歴事項全部証明書

履歴事項全部証明書とは、会社の情報が記載されている書類です。この書類を提出することで、補助金採択側は、円滑に申請者の情報を取得することが出来ます。申請の際は、交付申請書提出日より過去3か月以内に発行されている証明書の全てのページを添付する必要があります。

決算書

直近2年分の決算書を提出します。

見積書・見積依頼書

新事業で取得予定の資産の見積書を提出します。相見積もりが必要な場合もあるので、早い内から用意しましょう。見積書については、次の記事で詳細を解説しています。

▼事業再構築補助金で見積書・相見積もりが必要になるケースとは|書き方や諸条件を解説
https://planbase.co.jp/jsh-competitive-quotes/

<個人事業主の場合>

確定申告書

表に記載通り、直近2年分の確定申告書を提出します。

青色申告書/白色申告書

青色申告書は損益計算書(2ページ分)、白色申告書は収支内訳書の提出が必要になるので、注意しましょう。

建物費、機械装置・システム構築費ごとに追加書類が必要

建物費の申請時には、追加で機械装置やシステム構築費の場合は「価格の妥当性を証明するパンフレット」、海外から購入する場合は「換算に用いたレート表」が追加で必要になる点に注意しましょう。

交付申請書類が差し戻しされるケース

時間をかけて準備した補助金申請であっても、何らかの理由で差し戻しされるケースがあります。
差し戻しが起こるケースを紹介します。

提出書類が不足している

交付申請に必要な提出書類が不足している場合には、差し戻しの対象になります。上記で紹介した必要書類を複数人でチェックし、不足がないことを確認すると良いでしょう。同時に、書類への記入漏れや間違いがないことも入念に確認しておくのがポイントです。

見積書の有効期限が切れている

差し戻しになる場合、見積書の有効期限が切れているケースも少なくありません。交付申請の期限は3か月ほどありますが、見積書の期限は数週間〜1か月程度のことが多いです。

そのため申請時には有効期限切れになってしまい、提出書類として認められないことが考えられます。申請の際は、見積書の期限にも十分注意しましょう。

相見積書が不足している

単価50万円以上の申請をする場合、2社以上の相見積もり書が必要になります。相見積もり書も期限に注意した上で、「名称」と「大・中項目」が一致している必要があるため、提出前に確認しておきましょう。

事業再構築補助金の交付申請書類を提出する際の注意点

事業再構築補助金の交付申請書類を提出する際には、注意すべき点がいくつかあります。
以下では、提出時における注意点を解説します。

差し戻しがあった場合は「再申請」を行う

交付申請書の差し戻しがあった場合、その後「作成済みの申請」から「差戻し対応中」のものを確認し、内容の不備を修正します。修正が終わったら「申請する」のボタンを押すことで、再申請が可能です。

交付決定日よりも前に商品やサービスを購入しない

交付決定日前に購入した商品やサービスは、原則補助の対象外です。そのため交付申請を終えてから、必要な契約や発注を実施する必要があります。

差し戻しされた場合の対処法

事業再構築補助金の交付申請書類が差し戻しされた場合、対処法を確認して早急に対応する必要があります。
以下を参考に、差し戻しを受けた際の対処法を確認してください。

再申請を早めに行う

差し戻しを受けた際には、先ほど紹介した方法で早めに再申請をします。再申請しても新たなミスがあり、再度差し戻しになる可能性も懸念されます。

早めの対応を心がけ、事業計画のスケジュールを狂わせないように備えましょう。

認定支援機関に申請の修正を相談する

認定支援機関に差し戻しされたことを告げ、修正のサポートをしてもらうのも1つの対処法です。認定支援機関は申請におけるプロであるため、修正方法も的確にアドバイスしてくれます。

まとめ

本記事では、事業再構築補助金申請時の注意点や、差し戻しが起こった時の対処法について解説しました。

差し戻しが起こらないように、十分に必要事項を確認したうえで申請を行いましょう。

 

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この記事の執筆者

村上 貴弘

村上 貴弘

東京大学経済学部卒。
中小企業診断士、行政書士。
2019年株式会社プランベース創業。
2021年meditips行政書士事務所開業。
製造業、建設業、運輸業、ソフトウェア業など幅広い業種の補助金申請支援実績が豊富。特に事業再構築補助金やものづくり補助金、成長投資補助金といった大規模な補助金の申請に強みを持つ。